臨床運用朱砂雄黃治病已有數千年歷史，古人那時雖不知道汞、砷是什么，卻有辦法降低其中毒性——水飛法。水飛法是中藥炮制方法的一種，將不溶于水的礦物、貝殼類如朱砂、雄黃、珍珠等藥物研磨成極細膩粉末的方法。

將藥物敲碎后，放在乳缽或容器里，加入清水，研磨成糊狀，再加多量水攪拌，粗粉下沉，這時傾出混懸液，下沉的粗粒再進行研磨，如此反復，利用粗細粉末在水中懸浮性的不同，將不溶于水的礦物經反復研磨制備成極細粉末。最后將不能懸浮的雜質棄掉，合并混懸液，靜置后，分取沉淀，低溫干燥后再研散，就能得到極細的粉末了。

水飛的目的則是：除去雜質，潔凈藥物；使藥物達到一定的純度和細度，增加療效，偏于內服和外用；防止藥物在研磨過程中粉塵飛揚，污染環境；除去藥物中可溶于水的毒性物質，如砷、汞等。確保藥材的性味得到修正，功效達到入藥要求。